Superhero Mengaku Supervillain (2003)
Menukarkan Tubuh Superhero Lain
Di komik Ultimate Spider-Man #67 (2004), diceritakan bahwa Peter Parker dan Wolverine bertukar tubuh secara misterius, di mana kejadian ini mengarah pada adegan-adegan lucu, seperti Peter yang secara tidak senagaja meotong jarinya sendiri. Pada akhirnya terungkap bahwa Jean Grey sengaja menukar tubuh mereka karena merasa sangat kesal pada Wolverine. Walapun pada akhirnya tubuh mereka dikembalikan seperti semua, keputusan Jean Grey ini membuktikan bahwa dia sangat egois. Demi masalahnya dia sendiri, dia mengorbankan Peter Parker dan mungkin orang-orang yang ada didekatnya.
Menutupi Kesalahan Dengan Kebohongan (2005-2006)
Setelah sempat terlihat sembuh dari sikapnya yang kontroversial, lagi-lagi Professor X melakukan hal yang sama di komik X-Men: Deadly Genesis (2005-2006). Setelah sempat mengirim X-Men ke sebuah pulau misterius yang disebut Krakoa dan menyebabkan tim tersebut hilang, dia mencoba meyakinkan para X-Men senior untuk menyelamatkannya dan berhasil.
Namun, pada akhirnya terungkap bahwa tim yang diselamatkan tersebut bukan lah tim pertama yang hilang. Karena sebelumnya dia telah mengirim tim lain yang semua anggotanya mati di Krakoa, di mana salah satunya adalah saudara Cyclops bernama Gabriel. Untuk membuat Cyclops lupa dengan fakta tersebut, Professor X menggunakan telepatinya pada Cyclops.
Mengakui Identitas Rahasia Tanpa Tahu Konsekuensi
Salah satu keputusan konstroversial yang juga konyol pernah dilakukan oleh Spider-Man. Sebelumnya diceritakan di Marvel Comics bahwa Goblin telah membunuh kekasih Spider-Man yang bernama Gwen Stacy, hal itu bisa terjadi karena Goblin mengetahui identitas rahasia Spider-Man.
Mengusir Superhero Kuat dari Bumi (2007)
Entah apa yang membuat para superhero di tim Illuminati mengambil keputusan untuk menjauhkan Bruce Banner alias Hulk dari Bumi dengan mengirimnya ke Planet Sakaar. Karena hal itu justru membuat Hulk tumbuh makin kuat dan menaruh dendam pada Illuminati. Diceritakan di kisah World War Hulk (2007), Hulk bersama pasukan gladiator Sakaar yang disebut Warbound berhasil tiba di Bumi untuk balas dendam. Karena penyerangan Hulk, Kota New York menjadi hancur lebur, begitu juga dengan para superhero yang babak belur karena tidak berhasil mengalahkan Hulk.