Meninggalkan Pertemuan Lima Kage
Meskipun mungkin bisa dipahami mengapa Danzo kemudian menunjuk dirinya sendiri sebagai pengganti Tsunade, sayangnya Danzo melakukan hal yang diluar dugaan. Ketika Sasuke dan sekutunya menyerang pertemuan lima Kage tersebut, Danzo justru tidak ikut bertempur bersama yang lain. Dia malah pergi melarikan diri dari tempat tersebut.
Berusaha Membunuh Hiruzen Sarutobi
Salah satu bukti bahwa Danzo begitu ambisius untuk menjadi Hokage adalah berusaha menyingkirkan Hokage yang masih ada, demi merebut posisi tersebut. Selain melakukan berbagai strategi untuk membuat Konoha kacau, dan membuatnya menjadi Hokage, dia juga pernah berusaha membunuh Hiruzen Sarutobi dengan menyerangnya di sebuah hutan.
Pembunuhan Massal Klan uchiha
Mungkin tindakan kriminal yang paling mengerikan dan paling berdampak penuh terhadap cerita di universe Naruto adalah perannya sebagai otak dibalik peristiwa pembunuhan klan Uchiha. Danzo adalah sosok yang “mencuci otak” dari Itachi untuk memerintahkannya membunuh semua keluarganya. Hanya Sasuke dan Obito saja yang masih hidup dalam peristiwa tersebut.
Lengan Izanagi
Yang lebih gila lagi dari sosok Danzo pasca menjadi otak dibalik penghancuran klan Konoha adalah memanfaatkan situasi tersebut. Danzo dengan sengaja mengambil mata milik klan Uchiha tersebut untuk kemudian dipasang di lengannya. Karena itulah lengan Danzo penuh dengan mata Sharingan. Dengan adanya kekuatan tersebut, Danzo mampu memanipulasi realita sesuai keinginannya.
Menculik Sosok Karin
Setelah Danzo kalah dalam pertarungan melawan Sasuke, Danzo mulai putus asa untuk bisa membalikan keadaan. Dia kemudian menemukan sebuah cara dari sosok Karin, sang ninja medis yang melayani Danzo. Karena Karin lebih memfokuskan diri dalam masalah medis, sangat jarang Karin bertarung dan hal ini dimanfaatkan oleh Danzo dengan menjadikannya tawanan.