Civil War
Baik di MCU maupun di Marvel Comics, Civil War memiliki peran besar terhadap perubahan cerita. Tapi, untuk MCU sendiri Civil War merupakan sebuah titik balik dari universe tersebut. Dalam cerita ini, para pahlawan Marvel terbagi menjadi dua kubu dalam hal Superhero Registration Act. Kunci dari cerita ini adalah Tony stark. Dalam komiknya, Iron Man memiliki pengaruh besar seperti yang diperlihatkan dalam filmnya, melakukan lobi mengajak pahlawan lainnya untuk mendaftar.
House of M
Scarlet Witch udah jadi seorang villain, pahlawan, dan kembali menjadi villain. Jadi, mengkhianati rekan satu timnya adalah satu hal yang lumrah baginya. Dia bahkan pernah melakukan trik untuk memanipulasi She-Hulk dan mengalahkan Vision. Yang paling dramatis adalah ketika Wanda harus mengkhianati seluruh keluarganya dan seluruh ras mutan dalam peristiwa ikonik.
Dark Phoenix
Jean Grey adalah salah satu mutan yang paling kuat dalam cerita Marvel. Jean Grey terkenal karena kemampuan telekinesis dan juga telepatinya. Namun, meskipun kedua kekuatan itu sangat luar biasa ada kekuatan lainnya yang membuat Jean Grey jauh lebih kuat yaitu ketika dia menjadi wadah bagi salah satu kekuatan kosmik terbesar dan tertua, Phoenix Force.
Avengers vs X-Men
Dengan hilangnya seluruh mutan, Hope Summers adalah mutan baru pertama yang lahir setelah apa yang dilakukan oleh Wanda Maximoff dalam peristiwa House of M. Hope sudah diincar untuk menjadi wadah baru Phoenix force, menggantikan Jean Grey. Avengers, yang sudah tahu apa yang bakalan terjadi jika Phoenix Force menemukan wadah baru, berusah untuk mencegah hal tersebut.
Hail Hydra
Ini adalah salah satu cerita yang paling kontroversial di Marvel Universe. dalam peristiwa Secret Empire, terungkap kalau Captain America bukanlah sosok yang selama ini dipuja oleh banyak orang dengan menegakan nilai-nilai seorang warga Amerika yang baik. Tapi, dia adalah seorang agen rahasia Hydra yang menyamar. Tapi, tentunya ini tidak sepenuhnya benar.